Prinsip kerja mikroskop stereo adalah berdasarkan visi stereo binokular, yang menyediakan kaedah pemerhatian tiga dimensi melalui dua laluan optik bebas.
Inti mikroskop stereo terletak pada reka bentuk struktur optiknya, yang biasanya mengandungi kanta objektif utama yang biasa. Kedua -dua rasuk cahaya selepas pengimejan objek dipisahkan oleh dua set kanta objektif pertengahan (juga dipanggil kumpulan kanta zoom) dan membentuk sudut tertentu (umumnya 12 hingga 15 darjah), dan kemudian membentuk imej melalui eyepieces masing -masing. Reka bentuk ini menjadikan imej-imej yang dilihat oleh mata kiri dan mata kanan sedikit berbeza, dan otak menggabungkan imej-imej ini untuk membina semula rasa tiga dimensi objek.
